Peletizarea se face prin procesul de igienizare (menținerea peleților la o temperatură de 70°C timp de o oră), după care urmează răcirea și depozitarea. Prin igienizare se elimină agenții patogeni (bacterii precum Salmonella, E. coli, virusuri, paraziți și semințe de buruieni) și reprezintă o operațiune esențială pentru biosecuritate.

Pentru situațiile în care dejecțiile provenite din fermă au o umiditate mai mare de 18%, este necesar un uscător de dejecții cu bandă, în mai multe treceri.

Peleții proveniți din dejecții sunt un fertilizator foarte bun pentru câmpurile agricole.